Método destinado al análisis por PCR de muestras de grupos sanguíneos.
Método para identificar de manera exclusiva donaciones de fluido biológico con carga viral positiva,
comprendiendo el método las fases que consisten en:
- proporcionar una pluralidad de donaciones de fluido biológico;
- definir una matriz n-dimensional, donde n es un número entero, comprendiendo también la matriz una pluralidad de elementos internos, estando definido cada elemento por una intersección de n dimensiones de la matriz, siendo identificado cada elemento individual por una notación matricial correspondiente y comprendiendo la notación matricial correspondiente un índice para cada dimensión del conjunto;
- tomar una muestra de cada una de las donaciones de fluido biológico;
- proyectar cada muestra en un elemento determinado correspondiente de cada elemento de la matriz, siendo cada muestra individual identificada por su notación matricial respectiva del elemento correspondiente;
- tomar partes alícuotas de cada muestra, siendo el número de partes alícuotas tomadas de cada muestra definido por el número de dimensiones que caracterizan la matriz;
- formar subgrupos de las partes alícuotas de cada muestra, conteniendo cada subgrupo una parte alícuota procedente de todas las muestras identificadas por una notación matricial, en la que se fija un índice dimensional, siendo identificado cada subgrupo correspondiente por dicho índice dimensional fijado;
- analizar cada subgrupo mediante un análisis por PCR para detectar una indicación de carga viral positiva;
- determinar los índices dimensionales correspondientes de subgrupos que devuelven una indicación de carga viral positiva; y
- combinar dichos índices dimensionales en una notación matricial, identificando así de manera inequívoca un elemento de matriz único definido por la notación matricial, e identificando así de manera inequívoca una muestra de carga viral positiva exclusiva.
Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US1998/004123.
Solicitante: Baxalta Incorporated.
Nacionalidad solicitante: Estados Unidos de América.
Dirección: 1200 Lakeside Drive Bannockburn, IL 60015 ESTADOS UNIDOS DE AMERICA.
Inventor/es: PEDDADA,LORRAINE,B, HELDEBRANT,CHARLES,M, CONRAD,ANDREW,J.
Fecha de Publicación: .
Clasificación Internacional de Patentes:
- A61K39/12 NECESIDADES CORRIENTES DE LA VIDA. › A61 CIENCIAS MEDICAS O VETERINARIAS; HIGIENE. › A61K PREPARACIONES DE USO MEDICO, DENTAL O PARA EL ASEO (dispositivos o métodos especialmente concebidos para conferir a los productos farmacéuticos una forma física o de administración particular A61J 3/00; aspectos químicos o utilización de substancias químicas para, la desodorización del aire, la desinfección o la esterilización, vendas, apósitos, almohadillas absorbentes o de los artículos para su realización A61L; composiciones a base de jabón C11D). › A61K 39/00 Preparaciones medicinales que contienen antígenos o anticuerpos (materiales para ensayos inmunológicos G01N 33/53). › Antígenos virales.
- A61K48/00 A61K […] › Preparaciones medicinales que contienen material genético que se introduce en las células del cuerpo vivo para tratar enfermedades genéticas; Terapia génica.
- B01L3/00 TECNICAS INDUSTRIALES DIVERSAS; TRANSPORTES. › B01 PROCEDIMIENTOS O APARATOS FISICOS O QUIMICOS EN GENERAL. › B01L APARATOS DE LABORATORIO PARA LA QUIMICA O LA FISICA, DE USO GENERAL (aparatos de uso médico o farmacéutico A61; aparatos para aplicaciones industriales o aparatos de laboratorio cuya estructura y funciones son comparables a las de aparatos industriales similares, ver las clases relativas a los aparatos industriales, en particular las subclases B01 y C12; aparatos de separación o de destilación B01D; dispositivos de mezcla o de agitación B01F; atomizadores B05B; tamices, cribas B07B; tapones, capuchones B65D; manipulación de líquidos en general B67; bombas de vacío F04; sifones F04F 10/00; grifos, válvulas F16K; tubos, empalmes para tubos F16L; aparatos especialmente adaptados al estudio y análisis de materiales G01, particularmente G01N; aparatos eléctricos u ópticos, ver las subclases apropiadas en las secciones G y H). › Recipientes o utensilios para laboratorios, p. ej. cristalería de laboratorio (botellas B65D; equipos para enzimología o microbiología C12M 1/00 ); Cuentagotas (recipientes para volumetría G01F).
- C07H21/00 QUIMICA; METALURGIA. › C07 QUIMICA ORGANICA. › C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos.
- C12N15/09 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA. › C12N MICROORGANISMOS O ENZIMAS; COMPOSICIONES QUE LOS CONTIENEN; PROPAGACION, CULTIVO O CONSERVACION DE MICROORGANISMOS; TECNICAS DE MUTACION O DE INGENIERIA GENETICA; MEDIOS DE CULTIVO (medios para ensayos microbiológicos C12Q 1/00). › C12N 15/00 Técnicas de mutación o de ingeniería genética; ADN o ARN relacionado con la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos, o su aislamiento, su preparación o su purificación; Utilización de huéspedes para ello (mutantes o microorganismos modificados por ingeniería genética C12N 1/00, C12N 5/00, C12N 7/00; nuevas plantas en sí A01H; reproducción de plantas por técnicas de cultivo de tejidos A01H 4/00; nuevas razas animales en sí A01K 67/00; utilización de preparaciones medicinales que contienen material genético que es introducido en células del cuerpo humano para tratar enfermedades genéticas, terapia génica A61K 48/00; péptidos en general C07K). › Tecnología del ADN recombinante.
- C12N7/00 C12N […] › Virus, p. ej. bacteriófagos; Composiciones que los contienen; Su preparación o purificación (preparaciones de uso médico que contienen virus A61K 35/76; preparación de composiciones de uso médico que contienen antígenos o anticuerpos virales, p. ej. vacunas virales, A61K 39/00).
- C12Q1/68 C12 […] › C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
- C12Q1/70 C12Q 1/00 […] › en los que intervienen virus o bacteriófagos.
- G01N33/483 FISICA. › G01 METROLOGIA; ENSAYOS. › G01N INVESTIGACION O ANALISIS DE MATERIALES POR DETERMINACION DE SUS PROPIEDADES QUIMICAS O FISICAS (procedimientos de medida, de investigación o de análisis diferentes de los ensayos inmunológicos, en los que intervienen enzimas o microorganismos C12M, C12Q). › G01N 33/00 Investigación o análisis de materiales por métodos específicos no cubiertos por los grupos G01N 1/00 - G01N 31/00. › Análisis físico de material biológico.
- G01N33/50 G01N 33/00 […] › Análisis químico de material biológico, p. ej. de sangre o de orina; Ensayos mediante métodos en los que interviene la formación de uniones bioespecíficas con grupos coordinadores; Ensayos inmunológicos (procedimientos de medida o ensayos diferentes de los procedimientos inmunológicos en los que intervienen enzimas o microorganismos, composiciones o papeles reactivos a este efecto, procedimientos para preparar estas composiciones, procedimientos de control sensibles a las condiciones del medio en los procedimientos microbiológicos o enzimáticos C12Q).
- G01N35/00 G01N […] › Análisis automático no limitado a procedimientos o a materiales tratados en uno sólo de los grupos G01N 1/00 - G01N 33/00; Manipulación de materiales a este efecto.
- G01N35/02 G01N […] › G01N 35/00 Análisis automático no limitado a procedimientos o a materiales tratados en uno sólo de los grupos G01N 1/00 - G01N 33/00; Manipulación de materiales a este efecto. › utilizando una serie de recipientes con muestras desplazadas por un transportador que pasa delante de uno o más puestos de tratamiento o análisis.
PDF original: ES-2319937_T3.pdf
PDF original: ES-2319937_T5.pdf
Reivindicaciones:
1. Método para identificar de manera exclusiva donaciones de fluido biológico con carga viral positiva, comprendiendo el método las fases que consisten en:
- proporcionar una pluralidad de donaciones de fluido biológico;
- definir una matriz n-dimensional, donde n es un número entero, comprendiendo también la matriz una pluralidad de elementos internos, estando definido cada elemento por una intersección de n dimensiones de la matriz, siendo identificado cada elemento individual por una notación matricial correspondiente y comprendiendo la notación matricial correspondiente un índice para cada dimensión del conjunto;
- tomar una muestra de cada una de las donaciones de fluido biológico;
- proyectar cada muestra en un elemento determinado correspondiente de cada elemento de la matriz, siendo cada muestra individual identificada por su notación matricial respectiva del elemento correspondiente;
- tomar partes alícuotas de cada muestra, siendo el número de partes alícuotas tomadas de cada muestra definido por el número de dimensiones que caracterizan la matriz;
- formar subgrupos de las partes alícuotas de cada muestra, conteniendo cada subgrupo una parte alícuota procedente de todas las muestras identificadas por una notación matricial, en la que se fija un índice dimensional, siendo identificado cada subgrupo correspondiente por dicho índice dimensional fijado;
- analizar cada subgrupo mediante un análisis por PCR para detectar una indicación de carga viral positiva;
- determinar los índices dimensionales correspondientes de subgrupos que devuelven una indicación de carga viral positiva; y
- combinar dichos índices dimensionales en una notación matricial, identificando así de manera inequívoca un elemento de matriz único definido por la notación matricial, e identificando así de manera inequívoca una muestra de carga viral positiva exclusiva.
2. Método según la reivindicación 1, en donde la matriz es una matriz regular y cada una de las n dimensiones de dicha matriz se caracteriza por un número entero igual de elementos.
3. Método según la reivindicación 2, en donde la matriz regular comprende una matriz tridimensional, subdividida además la matriz en filas, columnas y capas, y en donde cada elemento se caracteriza por una notación matricial Xrcs, cuyos índices dimensionales r, c y s, respectivamente, identifican elementos que comprenden una fila, una columna y una capa de la matriz.
4. Método según la reivindicación 3, en donde la fase de formación de subgrupos comprende además:
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices r idénticos pero índices c y s diferentes;
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices c idénticos pero índices r y s diferentes;
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices s idénticos pero índices r y c diferentes; y
- evaluar cada uno de los subgrupos r, c y s para detectar una indicación de carga viral positiva devuelta mediante el análisis por PCR.
5. Método según la reivindicación 4, que comprende además las fases que consisten en:
- determinar el índice entero de cada subgrupo r que devuelve una indicación de carga viral positiva;
- determinar el índice entero de cada subgrupo c que devuelve una indicación de carga viral positiva; y
- determinar el índice entero de cada subgrupo s que devuelve una indicación de carga viral positiva.
6. Método según la reivindicación 5, que comprende además la fase que consiste en sustituir los índices enteros de cada subgrupo r, c y s que devuelve una indicación de carga viral positiva por los índices dimensionales r, c y s de la notación matricial identificando así un elemento único de la matriz definido por dicha notación matricial, identificando así de manera exclusiva la muestra de carga viral positiva correspondiente.
7. Método según la reivindicación 6, en donde la matriz tridimensional comprende una matriz regular de 8 x 8 x 8, tomando cada índice dimensional r, c y s valores de números enteros del 1 al 8.
8. Método según la reivindicación 7, en donde se toman tres partes alícuotas de cada muestra correspondiente de donaciones de fluido biológico.
9. Método según la reivindicación 8, que comprende además las fases que consisten en:
- formar ocho subgrupos de filas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de filas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de filas formado por 64 partes alícuotas de muestras;
- formar ocho subgrupos de columnas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de columnas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de columnas formado por 64 partes alícuotas de muestras; y
- formar ocho subgrupos de capas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de capas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de capas formado por 64 partes alícuotas de muestras.
10. Método para identificar de manera exclusiva donaciones de fluido biológico con carga viral positiva viral, comprendiendo el método las fases que consisten en:
- proporcionar una pluralidad de donaciones de fluido biológico;
- definir una matriz n-dimensional, donde n es un número entero, comprendiendo también la matriz una pluralidad de elementos internos, estando definido cada elemento por una intersección de n dimensiones de la matriz, siendo identificado cada elemento individual por una notación matricial correspondiente Xi....N, en donde el subíndice de la notación matricial define los índices dimensionales del conjunto;
- tomar N partes alícuotas de cada muestra de cada una de las donaciones de fluido biológico, estando el número de partes alícuotas tomadas de cada muestra definido por el número de índices dimensionales que comprende el grupo;
- formar subgrupos de las partes alícuotas de cada muestra, conteniendo cada subgrupo una parte alícuota de todas las muestras identificadas por una notación matricial en la que se fija un índice dimensional;
- analizar cada subgrupo mediante un análisis por PCR para detectar una indicación de carga viral; y
- evaluar los índices dimensionales de cada subgrupo que devuelve una indicación de carga viral positiva en el primer análisis por PCR, de acuerdo con una reducción mediante el método de menores, identificando la evaluación un elemento exclusivo definido por los índices dimensionales de cada subgrupo positivo si sólo un único subgrupo que represente cada índice dimensional devuelve una indicación de carga viral positiva, identificando así de manera inequívoca una muestra de carga viral positiva.
11. Método según la reivindicación 10, en donde la matriz es una matriz tridimensional regular, estando además la matriz subdividida en filas, columnas y capas, y en donde cada elemento se caracteriza por una notación matricial Xrcs, donde los índices dimensionales r, c y s, respectivamente, identifican elementos que comprenden una fila, una columna y una capa de la matriz.
12. Método según la reivindicación 11, en donde la evaluación de índices dimensionales identifica una pluralidad de elementos definidos por los índices dimensionales de cada subgrupo positivo si más de un subgrupo de un único índice dimensional devuelve una indicación de carga viral positiva, mientras que únicamente un solo subgrupo que representa cada uno de los índices dimensionales restantes devuelve una indicación de carga viral positiva, identificando así de manera inequívoca más de una muestra de carga viral positiva.
13. Método según la reivindicación 12, en donde la evaluación de índices dimensionales identifica elementos candidatos de carga viral positiva zn si cada subgrupos que representa un índice dimensional devuelve una indicación de carga viral positiva, donde z representa el número real de muestras con carga viral positiva y donde n representa el número de dimensiones que tiene una pluralidad de subgrupos positivos.
14. Método según la reivindicación 13, que comprende además la fase que consiste en tomar una parte alícuota más de cada muestra identificada en cada elemento candidato con carga viral positiva zn, analizar las partes alícuotas mediante un segundo análisis por PCR para detectar una indicación viral, e identificar de manera inequívoca todas las muestras con carga viral positiva.
15. Método según la reivindicación 11, en donde la fase de formación de subgrupos comprende también:
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices r idénticos pero índices c y s diferentes;
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices c idénticos pero índices r y s diferentes;
- formar subgrupos de partes alícuotas de muestras identificadas por índices s idénticos pero índices r y c diferentes; y
- evaluar cada uno de los subgrupos r, c y s para detectar una indicación de carga viral positiva devuelta mediante el análisis por PCR.
16. Método según la reivindicación 15, que comprende además las fases que consisten en:
- determinar el índice entero de cada subgrupo r que devuelve una indicación de carga viral positiva;
- determinar el índice entero de cada subgrupo c que devuelve una indicación de carga viral positiva; y
- determinar el índice entero de cada subgrupo s que devuelve una indicación de carga viral positiva.
17. Método según la reivindicación 16, que comprende además la fase que consiste en sustituir los índices enteros de cada subgrupo r, c y s que devuelve una indicación de carga viral positiva por los índices dimensionales r, c y s de la notación matricial identificando un único elemento de la matriz definido por dicha notación matricial, identificando así de manera exclusiva la muestra de carga viral positiva correspondiente.
18. Método según la reivindicación 17, en donde la matriz tridimensional comprende una matriz regular de 8 x 8 x 8, tomando cada índice dimensional r, c y s valores de números enteros del 1 al 8.
19. Método según la reivindicación 18, que comprende además las fases que consisten en:
- formar ocho subgrupos de filas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de filas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de filas formado por 64 partes alícuotas de muestras;
- formar ocho subgrupos de columnas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de columnas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de columnas formado por 64 partes alícuotas de muestras; y
- formar ocho subgrupos de capas, identificándose exclusivamente cada subgrupo de capas mediante un número entero comprendido entre 1 y 8, estando cada subgrupo de capas formado por 64 partes alícuotas de muestras.
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